Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPR35Q9HC97 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPR35Q9HC97 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR35Q9HC97 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms