Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN10Q9HC96 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN10Q9HC96 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN10Q9HC96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms