Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
YTHDC2Q9H6S0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
YTHDC2Q9H6S0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
YTHDC2Q9H6S0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
YTHDC2Q9H6S0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms