Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG10Q9H0Y0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG10Q9H0Y0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms