Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BHLHE41Q9C0J9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BHLHE41Q9C0J9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BHLHE41Q9C0J9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms