Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRCC1Q9C099 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRCC1Q9C099 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LRRCC1Q9C099 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRCC1Q9C099 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRCC1Q9C099 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRCC1Q9C099 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LRRCC1Q9C099 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LRRCC1Q9C099 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LRRCC1Q9C099 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRRCC1Q9C099 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRRCC1Q9C099 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms