Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT23Q9C075 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT23Q9C075 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT23Q9C075 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT23Q9C075 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms