Protein–RNA interactions for Protein: Q9C004

SPRY4, Protein sprouty homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY4Q9C004 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRY4Q9C004 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRY4Q9C004 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRY4Q9C004 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms