Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABARAPL3Q9BY60 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPL3Q9BY60 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms