Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNHG12Q9BXW3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNHG12Q9BXW3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SNHG12Q9BXW3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms