Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PINK1Q9BXM7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PINK1Q9BXM7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PINK1Q9BXM7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PINK1Q9BXM7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms