Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHID1Q9BWS9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHID1Q9BWS9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHID1Q9BWS9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHID1Q9BWS9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHID1Q9BWS9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHID1Q9BWS9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHID1Q9BWS9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHID1Q9BWS9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms