Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP58Q9BVL2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NUP58Q9BVL2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NUP58Q9BVL2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NUP58Q9BVL2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms