Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTDSS2Q9BVG9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS2Q9BVG9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS2Q9BVG9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms