Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MTA3Q9BTC8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MTA3Q9BTC8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MTA3Q9BTC8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MTA3Q9BTC8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms