Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEC22CQ9BRL7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEC22CQ9BRL7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms