Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BPIFA3Q9BQP9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BPIFA3Q9BQP9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BPIFA3Q9BQP9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms