Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMCHL2Q9BQD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PMCHL2Q9BQD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PMCHL2Q9BQD1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms