Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MTRQ99707 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MTRQ99707 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MTRQ99707 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTRQ99707 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTRQ99707 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTRQ99707 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTRQ99707 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTRQ99707 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTRQ99707 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTRQ99707 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTRQ99707 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTRQ99707 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTRQ99707 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MTRQ99707 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTRQ99707 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTRQ99707 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTRQ99707 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTRQ99707 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTRQ99707 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTRQ99707 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTRQ99707 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MTRQ99707 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTRQ99707 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTRQ99707 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTRQ99707 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTRQ99707 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTRQ99707 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTRQ99707 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTRQ99707 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTRQ99707 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTRQ99707 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTRQ99707 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTRQ99707 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MTRQ99707 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTRQ99707 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTRQ99707 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTRQ99707 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MTRQ99707 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTRQ99707 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTRQ99707 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTRQ99707 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTRQ99707 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MTRQ99707 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTRQ99707 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTRQ99707 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTRQ99707 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTRQ99707 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTRQ99707 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTRQ99707 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTRQ99707 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTRQ99707 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTRQ99707 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTRQ99707 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTRQ99707 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTRQ99707 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTRQ99707 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTRQ99707 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTRQ99707 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTRQ99707 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTRQ99707 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTRQ99707 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTRQ99707 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTRQ99707 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTRQ99707 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTRQ99707 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTRQ99707 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTRQ99707 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTRQ99707 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTRQ99707 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTRQ99707 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MTRQ99707 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MTRQ99707 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MTRQ99707 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MTRQ99707 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MTRQ99707 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MTRQ99707 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTRQ99707 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTRQ99707 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTRQ99707 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTRQ99707 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTRQ99707 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MTRQ99707 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTRQ99707 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTRQ99707 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTRQ99707 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MTRQ99707 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms