Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHP1Q99653 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHP1Q99653 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHP1Q99653 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms