Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF18Q99633 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPF18Q99633 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPF18Q99633 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms