Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 RIX7YLL034C 2514 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 HXK2YGL253W 1461 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 TFG2YGR005C 1203 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 YKL153WYKL153W 510 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 YMC1YPR058W 924 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 RPL21AYBR191W 483 nt5.29□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 PAB1YER165W 1734 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 YLL067CYLL067C 3618 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 EXG1YLR300W 1347 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 AMD2YDR242W 1650 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 RPS3YNL178W 723 nt5.28□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 SLX5YDL013W 1860 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 RAD59YDL059C 717 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 BUG1YDL099W 1026 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YDR187CYDR187C 519 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 THI4YGR144W 981 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 MGM101YJR144W 810 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 AAT2YLR027C 1257 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YMR122CYMR122C 375 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 SCS22YBL091C-A 528 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 TAE1YBR261C 699 nt5.27□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YDR278CYDR278C 318 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YMR252CYMR252C 405 nt5.26□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YML6YML025C 861 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YBL112CYBL112C 318 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 ILV1YER086W 1731 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 MCH1YDL054C 1461 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 ATG22YCL038C 1587 nt5.25□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 COA1YIL157C 594 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 GLC8YMR311C 690 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 KTR5YNL029C 1569 nt5.24□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 HRQ1YDR291W 3234 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 CRF1YDR223W 1404 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 CSC1YLR241W 2349 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YGL235WYGL235W 537 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 CCP1YKR066C 1086 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 CDC1YDR182W 1476 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 VHT1YGR065C 1782 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 OSW2YLR054C 2175 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 RVB2YPL235W 1416 nt5.23□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 PYC2YBR218C 3543 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 OPI7YDR360W 435 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 TMT1YER175C 900 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 OAC1YKL120W 975 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 PXL1YKR090W 2121 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 RSA4YCR072C 1548 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 YPR196WYPR196W 1413 nt5.22□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 RGD1YBR260C 2001 nt5.21□□□□□ -1.57
ATG40Q99325 SDH4YDR178W 546 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 MPC2YHR162W 390 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 TDH2YJR009C 999 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 ARA2YMR041C 1008 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YHR131CYHR131C 2553 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 RGT2YDL138W 2292 nt5.21□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YCK1YHR135C 1617 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 HDA1YNL021W 2121 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 PMP3YDR276C 168 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 ECM14YHR132C 1293 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 MRS1YIR021W 1092 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 VPS24YKL041W 675 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 DRE2YKR071C 1047 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 ICT1YLR099C 1185 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 RPS28AYOR167C 204 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 GPA1YHR005C 1419 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YDR514CYDR514C 1452 nt5.2□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 AFG1YEL052W 1530 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 MSP1YGR028W 1089 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 BCY1YIL033C 1251 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 TSR3YOR006C 942 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 MRC1YCL061C 3291 nt5.19□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 ALT2YDR111C 1524 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YPL136WYPL136W 369 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YPR123CYPR123C 435 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 IFA38YBR159W 1044 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 PFK2YMR205C 2880 nt5.18□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 NMT1YLR195C 1368 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 PGK1YCR012W 1251 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YIR042CYIR042C 711 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 LDS1YAL018C 978 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 DPH5YLR172C 903 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 DAP1YPL170W 459 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 ERG1YGR175C 1491 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 WHI2YOR043W 1461 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 POX1YGL205W 2247 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 RMD9YGL107C 1941 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 VTH1YIL173W 4650 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 VTH2YJL222W 4650 nt5.17□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 ACC1YNR016C 6702 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YET3YDL072C 612 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 RPT3YDR394W 1287 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 MDH1YKL085W 1005 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YOL163WYOL163W 510 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 RRS1YOR294W 612 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 HAS1YMR290C 1518 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 YTP1YNL237W 1380 nt5.16□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 PET112YBL080C 1626 nt5.15□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 AIM3YBR108W 2844 nt5.15□□□□□ -1.58
ATG40Q99325 GUD1YDL238C 1470 nt5.15□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.1 ms