Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AGAP3Q96P47 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGAP3Q96P47 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AGAP3Q96P47 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms