Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC115Q96NT0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC115Q96NT0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC115Q96NT0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms