Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00477Q96M19 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00477Q96M19 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00477Q96M19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms