Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAPZA3Q96KX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAPZA3Q96KX2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPZA3Q96KX2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPZA3Q96KX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms