Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LOXL4Q96JB6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LOXL4Q96JB6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LOXL4Q96JB6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LOXL4Q96JB6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms