Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPD52L3Q96J77 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TPD52L3Q96J77 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPD52L3Q96J77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms