Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SEC22AQ96IW7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEC22AQ96IW7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SEC22AQ96IW7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms