Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC41A3Q96GZ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms