Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
L3HYPDHQ96EM0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
L3HYPDHQ96EM0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
L3HYPDHQ96EM0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L3HYPDHQ96EM0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L3HYPDHQ96EM0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
L3HYPDHQ96EM0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
L3HYPDHQ96EM0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
L3HYPDHQ96EM0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L3HYPDHQ96EM0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L3HYPDHQ96EM0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms