Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF21BQ96EK2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PHF21BQ96EK2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PHF21BQ96EK2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms