Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ELP4Q96EB1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELP4Q96EB1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELP4Q96EB1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms