Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UTP4Q969X6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UTP4Q969X6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UTP4Q969X6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms