Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOP1MTQ969P6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TOP1MTQ969P6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TOP1MTQ969P6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TOP1MTQ969P6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms