Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFD1Q92890 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFD1Q92890 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFD1Q92890 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms