Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RAD50Q92878 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RAD50Q92878 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RAD50Q92878 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RAD50Q92878 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms