Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORBQ92753 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORBQ92753 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RORBQ92753 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORBQ92753 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORBQ92753 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORBQ92753 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORBQ92753 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORBQ92753 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORBQ92753 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORBQ92753 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RORBQ92753 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORBQ92753 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORBQ92753 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORBQ92753 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORBQ92753 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORBQ92753 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RORBQ92753 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORBQ92753 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORBQ92753 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORBQ92753 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORBQ92753 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORBQ92753 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RORBQ92753 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RORBQ92753 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RORBQ92753 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RORBQ92753 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RORBQ92753 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RORBQ92753 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORBQ92753 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORBQ92753 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORBQ92753 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORBQ92753 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORBQ92753 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORBQ92753 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RORBQ92753 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORBQ92753 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORBQ92753 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORBQ92753 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORBQ92753 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORBQ92753 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORBQ92753 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORBQ92753 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RORBQ92753 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORBQ92753 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORBQ92753 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORBQ92753 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RORBQ92753 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RORBQ92753 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORBQ92753 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORBQ92753 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORBQ92753 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RORBQ92753 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORBQ92753 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORBQ92753 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RORBQ92753 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORBQ92753 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORBQ92753 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORBQ92753 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RORBQ92753 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RORBQ92753 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RORBQ92753 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORBQ92753 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORBQ92753 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORBQ92753 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORBQ92753 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORBQ92753 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORBQ92753 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RORBQ92753 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RORBQ92753 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORBQ92753 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORBQ92753 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORBQ92753 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORBQ92753 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RORBQ92753 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORBQ92753 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORBQ92753 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RORBQ92753 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORBQ92753 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORBQ92753 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORBQ92753 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORBQ92753 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORBQ92753 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RORBQ92753 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms