Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RABGGTAQ92696 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RABGGTAQ92696 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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RABGGTAQ92696 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RABGGTAQ92696 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABGGTAQ92696 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
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