Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HERVK_113Q902F9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HERVK_113Q902F9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HERVK_113Q902F9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HERVK_113Q902F9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms