Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
CTTNBP2Q8WZ74 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CTTNBP2Q8WZ74 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CTTNBP2Q8WZ74 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CTTNBP2Q8WZ74 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.19■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
CTTNBP2Q8WZ74 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms