Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRSK1Q8TDC3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRSK1Q8TDC3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRSK1Q8TDC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRSK1Q8TDC3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms