Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB4

MGARP, Protein MGARP, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGARPQ8TDB4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MGARPQ8TDB4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MGARPQ8TDB4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MGARPQ8TDB4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MGARPQ8TDB4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms