Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNPRQ8TBG9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNPRQ8TBG9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNPRQ8TBG9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYNPRQ8TBG9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms