Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH3Q8TBE1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNIH3Q8TBE1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNIH3Q8TBE1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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