Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RP9Q8TA86 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RP9Q8TA86 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RP9Q8TA86 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RP9Q8TA86 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms