Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ5

TNIP2, TNFAIP3-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2Q8NFZ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNIP2Q8NFZ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNIP2Q8NFZ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNIP2Q8NFZ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNIP2Q8NFZ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms