Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VPS37AQ8NEZ2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS37AQ8NEZ2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS37AQ8NEZ2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms