Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPATA4Q8NEY3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPATA4Q8NEY3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPATA4Q8NEY3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms