Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE63

HIPK4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK4Q8NE63 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIPK4Q8NE63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIPK4Q8NE63 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIPK4Q8NE63 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms